一是完善養(yǎng)殖證制度。為加快漁業(yè)權(quán)物權(quán)化進(jìn)程，農(nóng)業(yè)部2003年印發(fā)《關(guān)于完善水域?yàn)┩筐B(yǎng)殖證制度試行方案》。在具體執(zhí)行中，一些地方將養(yǎng)殖證發(fā)給水域所屬的村，也有一些地方直接將養(yǎng)殖使用證發(fā)給養(yǎng)殖者。目前，完善水域?yàn)┩筐B(yǎng)殖確權(quán)制度，應(yīng)本著穩(wěn)定養(yǎng)殖承包經(jīng)營(yíng)權(quán)，調(diào)動(dòng)經(jīng)營(yíng)主體投入的積極性的原則，將養(yǎng)殖證直接發(fā)放給養(yǎng)殖者，以穩(wěn)定和完善漁業(yè)基本經(jīng)營(yíng)制度。
二是創(chuàng)新捕撈許可制度。捕撈權(quán)的表現(xiàn)形式就是捕撈許可證。我國(guó)長(zhǎng)期實(shí)行捕撈許可證制度，但隨著資源緊張和競(jìng)爭(zhēng)加劇，捕撈權(quán)益受損害的現(xiàn)象也屢見(jiàn)不鮮。嚴(yán)格執(zhí)行漁船、主機(jī)功率“雙控”制度，加強(qiáng)船網(wǎng)等主要生產(chǎn)要素監(jiān)管，切實(shí)控制捕撈強(qiáng)度：建立注冊(cè)驗(yàn)船師隊(duì)伍，強(qiáng)化漁船檢驗(yàn)和報(bào)廢制度；積極探索市場(chǎng)經(jīng)濟(jì)條件下捕撈配額管理的有效機(jī)制和途徑。
三是保護(hù)重要漁業(yè)水域資源，控制征用或占用規(guī)模，制定水域?yàn)┩空饔没蛘加醚a(bǔ)償辦法，妥善安置漁(農(nóng))民，保障漁(農(nóng))民合法權(quán)益。對(duì)一些涉水項(xiàng)目損害漁業(yè)權(quán)的情況，應(yīng)給予漁業(yè)權(quán)人合法的補(bǔ)償，涉水項(xiàng)目必須經(jīng)過(guò)環(huán)評(píng)論證。一些地方參照土地承包經(jīng)營(yíng)權(quán)確定的補(bǔ)償辦法和標(biāo)準(zhǔn)制定出臺(tái)了漁業(yè)水域占用補(bǔ)償實(shí)施辦法，在這方面已經(jīng)探索出新路。
