為加強和規(guī)范漁業(yè)船員管理，提高漁業(yè)船員素質(zhì)，維護漁業(yè)船員的合法權(quán)益，對現(xiàn)行漁業(yè)船員管理的規(guī)章、規(guī)范性文件進行整合，填補相關(guān)制度空缺，農(nóng)業(yè)部在深入調(diào)研并聽取各方面意見的基礎上，制定了《辦法》，以保障水上交通安全和漁業(yè)生產(chǎn)作業(yè)安全，推動漁業(yè)經(jīng)濟的健康發(fā)展。《辦法》共八章五十三條，主要規(guī)定了以下內(nèi)容：

一是進一步明確了漁業(yè)船員管理的基本制度、強化了漁船安全生產(chǎn)主體責任、對船員權(quán)利義務作出規(guī)定。明確了漁業(yè)船員實行持證上崗制度，凡在漁業(yè)船舶上工作的人員，都應當按本辦法的規(guī)定接受漁業(yè)船員培訓，經(jīng)考試合格，取得相應的漁業(yè)船員證書。同時，對船長、船員的職責、船長的權(quán)利義務以及船員值班基本職責等作出規(guī)定，并規(guī)定了相應的法律責任，進一步明確了船長和船員在保障漁業(yè)船舶安全方面應當履行的職責和應承擔的義務。

二是整合了漁業(yè)船員證書類別。《辦法》整合理順了《中華人民共和國漁業(yè)船員專業(yè)訓練發(fā)證辦法》、《農(nóng)業(yè)部漁政漁港監(jiān)督管理局關(guān)于發(fā)布<漁業(yè)船員服務簿>實施規(guī)定的通知》、《內(nèi)河漁業(yè)船舶船員考試發(fā)證規(guī)則》、《中華人民共和國漁業(yè)船舶普通船員專業(yè)基礎訓練考核發(fā)證辦法》、《中華人民共和國海洋漁業(yè)船員發(fā)證規(guī)定》等規(guī)定，將漁業(yè)船員證書類別進行了整合，使每位漁業(yè)船員持有證書數(shù)量由此前要求的2~3本簡化為1本。

三是調(diào)整了漁業(yè)職務船員的等級、職級劃分。根據(jù)目前漁業(yè)船員管理的規(guī)定，漁業(yè)職務船員等級劃分過細，劃分標準也不夠科學，不能適應新形勢下漁業(yè)生產(chǎn)以及漁業(yè)船員管理的要求，與有關(guān)國際公約要求不一致，在管理和實踐中也存在操作性差、程序繁瑣等問題?！掇k法》將駕駛?cè)藛T的分級標準由噸位調(diào)整為船舶長度，取消了有限航區(qū)和無限航區(qū)的劃分，明確海洋職務船員的駕駛?cè)藛T包括船長、船副和助理船副，輪機人員包括輪機長、管輪和助理管輪，等級均分為三等，使海洋漁業(yè)職務船員各類崗位層級減少了65%。

四是調(diào)整了漁業(yè)船舶職務船員的最低配員標準?！掇k法》明確了不同長度和主機總功率海洋漁船的配員標準，在確保漁船航行作業(yè)安全的前提下，根據(jù)漁船操作自動化的實際情況，在廣泛調(diào)研、充分聽取基層意見的基礎上，降低了部分中小型漁船的職務船員最低配員要求，使之更加切合實際。此外，考慮到內(nèi)陸漁業(yè)船舶航行條件和海洋差異較大，且各地情況不一，《辦法》規(guī)定內(nèi)陸漁業(yè)船舶船員最低配員標準由各省漁業(yè)行政主管部門自行制定，報農(nóng)業(yè)部備案。