過去通常將蕨類植物門下分為五個綱：松葉厥綱、水韭綱、木賊綱（鍥葉綱）、真厥綱。前四綱是小葉型蕨類，較為原始古老，現(xiàn)存較少；而真厥綱是大葉型蕨類，現(xiàn)存最為繁茂。1978年，我國蕨類植物家秦仁昌教授把五綱提升為五個亞門：松葉厥亞門、鍥葉亞門（木賊亞門）、水韭亞門、真厥亞門。

　　重要藥用植物：石松科：石松全草能祛風散寒、舒筋活血、利尿通經(jīng)。玉柏、垂睡石松、高山扁枝石松等全草亦供藥用。

　　木賊科：木賊全草能收斂止血、利尿、明目退翳；問荊全草能利尿、止血、清熱、止咳；節(jié)節(jié)草全草具有清熱利濕、平肝散結、祛痰止咳作用；筆管草全草能利濕、退翳等；卷柏：全草含多種雙黃酮。生用能破血，治閉經(jīng)腹痛，跌大損傷醫(yī)學|教育網(wǎng)搜集整理；炒炭用止血，治吐血，便血、尿血、脫肛。

　　木賊：全草能收斂止血，利尿、明目退翳。

　　問荊：全草能利尿、止血、清熱、止咳。

　　紫萁：根莖入藥作“貫眾”用，能清熱解毒、祛瘀殺蟲、止血。

　　海金沙粗莖鱗毛蕨：根莖連同葉柄殘基藥用，中藥稱綿馬貫眾，可驅(qū)條蟲和十二指腸蟲，止血，并用治流行性感冒等。

　　貫眾：根莖在南方作“貫眾”用，功用同上種。